کتاب احکام مهاجران دو بخش دارد: بخش اول احکام مخصوص مهاجران است و مسائل مختلفی را که برای مهاجران اتفاق می افتد بررسی می کند. برخی از این مسائل عبارتند از: حکم مهاجرت کردن، کافرشدن و اقامت گرفتن، دوست شدن با کفار، دعا کردن برای کفار، کمک به کفار، عیادت کافر، صدقه دادن به کافر، مدارس مختلط، رفتن به اماکن فساد، تشریح بدن کفار، رفتنپیش دکتر نامحرم، دروغ گفتن به کفار، دست دادن به نامحرم و نظایر آن. بخش دوم کتاب هم احکام عمومی است که از باب تقلید آغاز می شود و تا به خوردنیها و آشامیدنی ها ادامه دارد.